Metody zpracování dat a informační databáze MDE-4-PK
Název předmětu Metody zpracování dat a informační databáze (MDE)
Garant RNDr. Pavel Řehulka, Ph.D.
Katedra Katedra molekulární patologie a biologie
Předmět specializace NE
Předmět profilujícího základu NE
Teoretický předmět PZ NE
Státní zkouška NE
Vícesemestrální předmět NE
Předmět jiné školy NE
Volitelnost Povinný
Klasifikace Zkouška
Kredity 5
Dop. roč./sem. 1/1
Počet týdnů 14

Témata

Celkem (h) Př. Cv. Lab. Sem. Kurzy Praxe Stáže Soustř. Exkurze Terén SP Konzultace PV
Základní pojmy a definice 4 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0
Nukleotidové sekvenční databáze 4 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0
Proteinové sekvenční databáze 4 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0
Nástroje sekvenčních databází 4 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0
Databáze proteomických experimentálních dat 4 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0
Základy LC-MS a identifikace proteinů 4 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0
Zpracování LC-MS dat 4 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0

Literatura


Doporučená:
Claverie J-M, Notredame C. Bioinformatics For Dummies, 2nd Edition. Available from: https://www.wiley.com/en-cz/Bioinformatics+For+Dummies%2C+2nd+Edition-p-9780470089859
Baxevanis AD et al. Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins, 3rd Edition. Available from: https://www.wiley.com/en-cz/Bioinformatics%3A+A+Practical+Guide+to+the+Analysis+of+Genes+and+Proteins%2C+3rd+Edition-p-9780471478782
Eidhammer I et al. Computational methods for mass spectrometry proteomics. Chichester, England; Hoboken, NJ: John Wiley & Sons; 2007.
Liquid Chromatography Techniques. In Westermeier R. et al. Proteomics in Practice. John Wiley & Sons, Ltd; 2008. 151–213. DOI: 10.1002/9783527622290.ch6.
Mass Spectrometry. In Westermeier R. et al. Proteomics in Practice. John Wiley & Sons, Ltd; 2008. 215–72. DOI: 10.1002/9783527622290.ch7.

Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta

zkouška

Rozsah konzultací